جميع الزواحف المائية تتنفس الهواء إلى الرئتين. البنية التشريحية للرئتين أقل تعقيدًا في الزواحف منها في الثدييات، حيث تفتقر الزواحف إلى بنية شجرة مجرى الهواء الواسعة جدًا الموجودة في رئات الثدييات. غير أن تبادل الغازات في الزواحف لا يزال يحدث في الحويصلات الهوائية، ولكن الزواحف لا تمتلك غشاء.