إنّ معرفة الإجابة عن سؤال: كيف أصلي صلاة الوتر؟ لا تستقيم إلّا بالرجوع لكيفية أداء النبي محمد -صلّى الله عليه وسلّم- لصلاة الوتر، فهو القائل صلّوا كما رأيتموني أصلي، ويجب اتبّاع النبي محمد في العبادات وعدم الابتداع فيها وفقًا للهوى، وقد أخبرت الأدلّة الشرعية أنّ رسول الله كان يقرأ في الركعة الأولى من صلاة الوتر سورة الأعلى وفي الثانية سورة الكافرون وفي الثالثة سورة الإخلاص بالإضافة إلى سورة الفاتحة الواجبة في كل ركعة فقراءة هذه السور في صلاة الوتر من الأمور المستحبة والمسنونة.
فرسول الله كان يُحافظ على صلاة الوتر في الحضر والسفر، ولكنّ عدد الركعات التي يُصلّيها في الوتر كانت متنوعة، فكان يُصلّي ثلاث ركعات أو خمسة أو سبعة أو إحدى عشر، إلى غير ذلك من الأعداد الفردية، أمّا عن أفضل وقت لتأدية صلاة الوتر فهو أمر نسبي فأفضل وقت بالنسبة لمن يخاف أن لا يستيقظ قبل صلاة الفجر هو أوّل الليل، وأفضل وقت لمن غلب على ظنّه أنّه سيؤديّ الوتر قبل صلاة الفجر هو آخر الليل.