على الرغم من أن نخالة القمح غذاء كثيف بالمغذيات والعناصر الغذائية الضرورية للجسم، إلا أن هناك بعض الأمور التي يجب أن تؤخذ بعين الاعتبار عند استهلاكها ومنها:
يعتبر الغلوتين من عائلة البروتينات، وقد يواجه بعض الأشخاص صعوبة بالتعامل مع هذا النوع من البروتين نتيجة لإصابتهم بمرض حساسية الغلوتين.
يصنف الفركتان على أنه نوع قليل السكاريد وهو كربوهيدرات تتكون من سلسلة من جزيئات الفركتوز مع جزيء الجلوكوز، والتي تعتبر مركبات غير قابلة للهضم وتختمر في القولون.
ويمكن أن ينتج عن عملية التخمير غازات وتجشؤ وإسهال خاصة الأشخاص المصابين بمتلازمة القولون العصبي.
يعتبر حمض الفيتيك مادة مغذية موجودة في جميع بذور النباتات بما في ذلك منتجات القمح الكامل والتي تتركز بشكل خاص في نخالة القمح.
قد يعيد تتواجد حمض الفايتيك من امتصاص بعض المعادن مثل الزنك والمغنيسيوم والكالسيوم والحديد.