كما هو الحال في جميع أنواع الجراحات الأخرى، فلا بد من وجود بعض المخاطر، ومن أهم المخاطر التي من المحتمل حدوثها عند الخضوع لجراحة إزالة الغدد العرقية من الإبط الاتي: