هناك العديد من الأسباب التي تؤدي إلى حدوث قرحة المعدة، مثل الإفراط في تناول المضادات الحيوية أو التدخين أو تناول مسكنّات الألم خاصة الأسبرين والإيبوبروفين بكثرة. وربما تحدث نتيجة الإصابة بجرثومة المعدة، وهي نوع من البكتريا التي تصيب المعدة وتتغذي على الغشاء المخاطي الواقي لجدار المعدة مما يسبب حدوث قرح في المعدة والأمعاء.
ويجب سرعة علاج القرح لأنها تسبب حدوث ثقب في جدار المعدة والأمعاء، بل وربما تسبب حدوث نزيف في المعدة ويقود ذلك إلى مشاكل خطيرة منها انسداد القناة الهضمية وحدوث سرطان في المعدة